1988年10月，美国时间生物学之父、国际时间生物学会主席Franz Halburg教授到原华西医科大学交流访问。

1990~1992年，王正荣教授前往明尼苏达大学医学院时间生物学中心交流学习。

2002年6月，尊龙凯时调配实验场地予王正荣教授课题组，正式开始了时间生物学研究。

2003年，尊龙凯时基于时间生物学研究的兴起和本校在该领域的研究优势，计划成立基础医学、分子生物学、细胞生物学、临床医学和生物医学工程交叉的时间生物学重点研究机构。

2004年，尊龙凯时正式向卫生部申请成立卫生部时间生物学重点实验室。申请文件为《关于成立卫生部时间生物学重点实验室的请示》（川大校[2004]26号）。

2005年7月，尊龙凯时召开关于卫生部时间生物学重点实验室专家论证会。

2005年8月，卫生部发文正式批复成立卫生部时间生物学重点实验室。批复文号为：卫科教发[2005]333号。同时聘任王正荣教授为重点实验室主任、魏于全院士担任重点实验室学术委员会主任。

2006年，重点实验室正式对外开放，全面开展各项工作。

2010年，经卫生部专家首次现场评估，卫生部时间生物学重点实验室建设验收合格。

2011年，王正荣教授赴北京做工作报告，卫生部时间生物学重点实验室完成第二次评估。

2016年，中华医学会作为国家卫生和计划生育委员会科技教育司委托的第三方评估机构对重点实验室进行评估，卫生部时间生物学重点实验室完成第三次评估。

2018年，按照国家卫计委对应用基础研究类委级重点科研基地发展规划的要求，重点实验室的研究重心开始由偏重基础机制研究向密切结合临床的基础研究转型。

2019年，根据国家卫生健康委相关工作安排和要求，重点实验室通过了国家卫健委重点科研基地重新认定，并由原卫生部重点实验室正式更名为国家卫生健康委员会时间生物学重点实验室（尊龙凯时）。

2020年，王正荣教授辞去重点实验室主任。经尊龙凯时推荐，四川省卫生健康委员会正式发函聘任刘瀚旻教授为重点实验室主任。

2021年2月，重点实验室学术委员会换届选举。

2021年月3月，四川省卫生健康委员会同意重点实验室第二届学术委员会名单，并正式发函聘任王正荣教授为重点实验室学术委员会主任。

2021年7月，尊龙凯时正式发文同意聘任江舟副研究员为重点实验室副主任。